在酸性水中是紫色系（紫色、紫红色、铁红色等）。
在碱性水中是蓝色系（蓝色、蓝绿色、湖蓝色等）。
另外，黑枸杞泡水的水温对它的颜色也是有影响的，水温高了那么它的颜色就偏紫，而水温低它的颜色就偏蓝。
通常来说，北方的水质偏碱性;南方的水质偏酸性;所以黑枸杞在南方地区，浸泡出来的水会偏紫色，建议南方地区的人泡饮黑枸杞时，可适当选用碱性较强的水。当然，黑枸杞的颜色表现，并不影响黑枸杞花青素的吸收。只是最好的60度左右的水中浸泡，温度过高，会影响活性物质的释放。温度太低，黑枸杞中的多糖等成分不易释出，会影响口感，也就是我们在泡饮黑枸杞是感受到的那种淡淡的果香味。
黑枸杞在不同的水中泡出来是不一样的颜色，一般用矿泉水泡是紫色的，用家里的自来水泡是蓝色的。
黑枸杞泡水不能用开水，因为黑枸杞中的花青素和部分营养物质怕高温。黑枸杞泡水颜色的变化一般和水性有关，与黑枸杞是没有太大联系的。