函授、自学考试都颁发国家承认的学历证书，毕业证书获得者的待遇与普通高校同类毕业生相同，都可以参加硕士研究生考试、公务员考试等。
1.办学主体不同
各大学都有相应的成人教育学院或继续教育学院，所以函授的办学主体一般为各大学的成教院。自考由相关的主考院校+省自考办联合办学。
2.学习形式不同
函授由相关院校老师在寒、暑假或者节假日到相关函授站进行授课，采用线上+线下结合的模式进行学习。
自考有主要分为两种学习模式：
①完全自主学习，整个自考流程下来包括院校选择、购买资料、自考报名到最后的毕业都是自己完成。
②报考相关培训机构，这种你可以节省很多的时间，比如机构会有老师提醒你参加考试、报名时间，当然，并不是说一定要去报班，考生可以根据自己的情况进行选择。
3.毕业证书不同
函授是由成教院颁发的毕业证书，盖的是相关成教院的公章。自考是由省自考办+相关主考院校联合颁发，盖的是主考院校+省自考委的公章。
不论是函授还是自考，只要毕业了，其毕业证都是国家承认的。但如果非要在其中比个高低的话，应该说，最难考的自考含金量最高。
自考的含金量肯定是高于函授的。而且自考的含金量是仅次于统招的，国家承认的城市也有不少，国外也有二十多个国家承认自考本科。
函授入学方式属于严进宽出，学生只有通过国家统一的成人高考考试，才能入学就读。就像高考一样，也要填志愿。但只要你考上了，一般来说毕业都不会太困难。
自考学历文凭考试入学叫宽进严出，学员入学时不需要通过考试，直接就可入学，但如果你想得到国家承认的毕业证，就得一门一门的通过国家的考试。所不同的是，自考是全都是由国家出题考试，难度最大