自考本科和高考本科在学习方式、毕业要求、毕业证上有区别，但不论是通过自考还是高考获得的毕业证都是国家承认的学历证书，都可以用来考研、考公务员和事业单位以及从参加资格类证书考试。
1、学习方式不同
高考本科也就是统招本科需要参加全国统一高考而入学，自考本科只需要去自考办报名即可入学。
2、毕业要求不同
高考本科只要修满学校规定的学分、完成毕业论文、通过论文答辩就能毕业。自考本科毕业需要有学信网上能查到的专科前置学历，考完本专业考试计划所规定的理论课程且考试成绩合格、并且完成该专业所规定的实践性环节课程考核，取得合格成绩。只有满足这些条件了，才能在规定时间申请毕业。
3、毕业证的区别
一个全日制本科，一个是自考本科，证书上会有标明。“自考本科”学生的毕业证书除主考院校印章外，加盖高等教育自学考试委员会印章。但是自考本科学历是国家承认的，与全日制本科的待遇没有什么大的区别，主要还是看个人和每个单位的看法，一般政府机关应该是视二者同等地位。
自考本科符合条件可以申请学位证，申请学位证的程序如下：
1、高等教育自学考试本科毕业生符合学士学位审批条件，于发毕业证的同时向当地教育考试院或自学考试办公室提出申请，填写学士学位评定表一式2份，交2寸免冠照片一张。
2、市考试院或自考办对申请人档案材料（包括本科毕业生鉴定表、毕业论文原件及论文成绩单）和毕业生填写的学士学位评定表进行审定，无误后，于3月底报省考试院。
3、省考试院整理汇总各市地申报的学士学位材料，进行初审，初审合格者将考生档案材料与学士学位名册于每年4月推荐给有授予权的主考学校。
4、主考学校学士学位主管部门和学术委员会按要求对申请学位者逐个评审，评审合格，授予学士学位，未通过者不再补授。