可以。机械设计制造及其自动化专业属于工程类专业，因此符合报考二建的专业条件，但是除了专业外，想要考二建还需要满足学历及工作年限的要求。

凡遵纪守法，具备工程类或工程经济类中等专科以上学历并从事建设工程项目施工管理工作满2年的人员，可报名参加二级建造师执业资格考试。有关工作年限的要求是指报考人员取得学历前后从事本专业工作时间的总和，按满周年计算。