虹吸式马桶的缺点是池底存水面积增大，而直冲式马桶的缺点是冲击管壁的声音比较大。

虹吸式马桶分旋涡式虹吸和喷射式虹吸，虹吸式马桶内有一个完整的管道，形状呈侧倒状的"S"，池壁坡度较缓，具有排污能力强，选净面大的特点。

直冲式马桶是利用被压缩的空气，形成推力的后排水式马桶，具有冲水速度快，冲力大，强排污，速度快，用水少，不泄漏的特点。