蝙蝠既不是益虫也不是害虫，蝙蝠是真正有飞翔能力的哺乳动物，蝙蝠不属于虫类。蝙蝠是嵴索动物门、哺乳纲下的一类动物，是唯一能够真正飞翔的哺乳动物；除一般哺乳动物的特点外，还有一系列适应飞行的形态特征。

已知最早的蝙蝠化石是有5000万年历史的食指伊神蝠，是在美国怀俄明州发现的。后来发现德国的麦塞尔湖湖床层内有更完整的蝙蝠化石，这些化石可以追溯到始新世时期，它们的胃里包含有成了化石的昆虫。这些早期的蝙蝠有许多和现存的小蝙蝠亚目相似，因而很难重现它们进化中的早期阶段，但是它们耳蜗的结构表明它们几乎肯定是使用回声定位的。

蝙蝠具有很强的飞行能力，同时也是多种人畜共患病毒的天然宿主，能够携带数十种病毒。蝙蝠与其能够飞行并进行夜间生活相适应，它们在生理机能上也发生了一系列重要变化。通常蝙蝠的视觉较差，而听觉则异常发达，在夜间或十分昏暗的环境中它们能够自由地飞翔和准确无误地捕捉食物。70％的蝙蝠种类主要以昆虫和其他小节肢动物为食。